Schon als Kind wurde Lara von einer unstillbaren Neugier angetrieben. Ihr Vater, Lord Richard Croft, ein Archäologe und Aristokrat, war oft auf Expeditionen, wodurch sie schon früh unabhängig werden musste.
An der Universität lernte sie ihre beste Freundin, Samantha Nishimura, kennen. Sam ermutigte Lara dazu, Spaß zu haben und das Leben abseits der stillen Säle von Schulen und Museen zu genießen.
Als sich die Gelegenheit zu einer archäologischen Expedition auf die Insel Yamatai ergab, nutzte Lara sie sofort. Ihr Mentor Conrad Roth hatte sie und Sam für die Reise ausgewählt.
Doch bevor sie ihr Ziel erreichen konnten, kam es zur Katastrophe. Ihr Schiff geriet in einen Sturm und wurde zerstört. Die Expeditionsmitglieder wurden an unterschiedliche Küstenabschnitte gespült. Lara machte sich auf die Suche nach ihrer Crew, was von der Solarii-Bruderschaft erschwert wurde, die sich auf der Insel eingenistet hatte und sie verfolgte. Schließlich stieß sie auf Sam und den angeblich auf der Insel gestrandeten Mathias, aber als Lara ohnmächtig wurde, verschwanden Sam und Mathias.
Auf ihrer Suche nach Sam erfuhr Lara, dass die Bruderschaft nach einem Körper für eine uralte Königin suchte und, angeführt von Mathias, überzeugt davon war, diesen Körper in Sam gefunden zu haben. Als Lara sie endlich in einer Höhle unter einem Wasserfall aufspürte, stand Sam schon auf einem Scheiterhaufen. Die Bruderschaft wollte prüfen, ob sie die Richtige war oder ob sie einfach verbrennen würde.
In einem verzweifelten Versuch, Sam zu retten, schoss Lara einen Pfeil ab und erledigte damit den Fackelträger. Aber da sie allein war, wurde sie schnell von der Bruderschaft gefangen und verprügelt. Als zwei Wachen sie über eine natürliche Steinbrücke schleiften, umgab sie ein unnatürlicher schwarzer Nebel. Ihre Gegner ließen sich davon ablenken, und so riss Lara sich los und sprang von der Brücke in den Fluss aus Blut unter ihr.
Als sie versank, griffen Dutzende Arme nach ihr, zerrten an ihr, entrissen ihr ihren Bogen und zogen sie nach unten. Es war, als wäre der Fluss lebendig. Sie trat wild um sich und kämpfte sich an die Oberfläche. Schließlich entkam sie der abscheulichen Flüssigkeit und fand sich in einem völlig neuen Albtraum wieder.
